Cuando meto el pendrive en el ordenaodr que tiene conectada la pizarra digital sale este mensaje: win no disco (reintentar, cancelar...) ¿que puedo hacer?

Prueba a conectar primero el pendrive, si no te da problemas conecta entonces la pizarra. Si te los da, evidentemente es un problema de la configuración del Sistema Operativo.
De todas formas te aconsejo que pases antes tus prácticas al HD del ordenador y luego las cargues desde allí. Otra solución si persiste el problema es utilizar un disco virtual web (los tienen casi todos los correos webmail comerciales como msn, gmail, lycos...) La ventaja es que si tu conexión a internet es mínimamente decente (algo que no ocurre en todos los colegios)lo tienes siempre disponible.

Un saludo